Nos recherches visent à faire progresser les connaissances sur les tiques et les micro-organismes qu’elles hébergent, pour évaluer voire prévenir les risques sanitaires associés. Nos approches et disciplines incluent l’écologie, la génétique des populations, la phylogéographie, la systématique, la génomique et la modélisation de la dynamique des populations de tiques, ainsi que l’étude des liens entre tiques et divers microorganismes, comme les apicomplexes (Babesia spp. et Theileria spp.), des bactéries pathogènes (Anaplasma spp., Borrelia spp.) ou symbiotiques (Midichloria mitochondrii) et enfin certains virus (CCHFV, iflavirus).
Nos travaux sont réalisés (1) au laboratoire, grâce notamment à notre élevage et à nos collection de tiques, à nos cultures cellulaires et collections de souches de Babesia, et à travers des approches de biologie moléculaire et d’infectiologie, (2) sur le terrain, au travers de collecte de tiques et de suivis de dynamique des populations et des variables environnementales (climat, paysage) influençant l’abondance des tiques et (3) in silico, par modélisation dynamique des processus qui déterminent la répartition spatiale et l’abondance des tiques, ainsi que par l’analyse bioinformatique des données de séquençage.
Nos projets de recherche s’articulent sur deux axes principaux. Premièrement, nous étudions l’écologie du système tiques-microorganismes associés, avec comme exemples l’évaluation des conséquences du changement climatique sur la dynamique des populations de tiques et l’étude de l’effet de l’abondance et de la diversité plus ou moins importantes des hôtes sur la présence d’agents pathogènes. Deuxièmement, par des approches de génétique et de génomique, nous étudions la diversité génétique inter et intra-spécifique des composantes de ce même système : c’est le cas par exemple de la piroplasmose équine, des Anaplasma infectant les petits ruminants, mais aussi des tiques elles-même, à travers une étude de séquençage génomique complet pour plusieurs espèces du genre Ixodes.
Our research aims at advancing the knowledge of ticks and the microorganisms they harbor, in order to assess and prevent associated health risks. Our approaches and disciplines include ecology, population genetics, phylogeography, systematics, genomics and modelling of tick population dynamics, as well as the study of links between ticks and various microorganisms, such as apicomplexes (Babesia spp. and Theileria spp.), pathogenic bacteria (Anaplasma spp., Borrelia spp.) or symbiotic bacteria (Midichloria mitochondrii) and finally some viruses (CCHFV, iflavirus).
Our work is carried out (1) in the laboratory, thanks to our tick breeding and collection, our cell cultures and collections of Babesia strains, and through molecular biology and infectiology approaches, (2) in the field, through tick collection and monitoring of population dynamics and environmental variables (climate, landscape) influencing tick abundance, and (3) in silico, through dynamic modeling of the processes that determine tick spatial distribution and abundance, as well as through bioinformatics analysis of sequencing data.
Our research projects have two main focuses. First, we study the ecology of the tick-microorganism system, with examples such as the evaluation of the consequences of climate change on tick population dynamics and the study of the effect of host abundance and diversity on the presence of pathogens. Secondly, through genetic and genomic approaches, we study the inter- and intra-specific genetic diversity of the components of this same system: this is the case, for example, of equine piroplasmosis, of Anaplasma infecting small ruminants, but also of the ticks themselves, through a complete genomic sequencing study for several species of the genus Ixodes.
Ixodes ricinus, Ixodes frontalis, Ixodes spp., Dermacentor spp., Haemaphysalis spp., Hyalomma marginatum
Babesia spp., Theileria spp., Anaplasma spp., Midichloria mitochondrii, virus CCHF
- Agoulon A., Hoch T., Heylen D., Chalvet-Monfray K., Plantard O. 2019. Unravelling the phenology of Ixodes frontalis, a common but understudied tick species in Europe. Ticks and Tick-borne Diseases, 10(3):505-512 [IF18=3.055] DOI: 10.1016/j.ttbdis.2018.12.009.
- Bonsergent C., de Carné M.-C., de la Cotte N., Moussel F., Perronne V., Malandrin L. 2021. The New Human Babesia sp. FR1 Is a European Member of the Babesia sp. MO1 Clade. Pathogens, 10(11):1433 [IF20=3.492] DOI: 10.3390/pathogens10111433.
- Charrier N. P., Hermouet A., Hervet C., Agoulon A., Barker S. C., Heylen D., Toty C., McCoy K. D., Plantard O., Rispe C. 2019. A transcriptome-based phylogenetic study of hard ticks (Ixodidae). Scientific Reports, 9(1):12923 [IF20=4.379] DOI: 10.1038/s41598-019-49641-9.
- Daveu R., Hervet C., Sigrist L., Sassera D., Jex A., Labadie K., Aury J.-M., Plantard O., Rispe C. 2021. Sequence diversity and evolution of a group of iflaviruses associated with ticks. Archives of Virology, 166:1843-1852 [IF20=2.574] DOI: 10.1007/s00705-021-05060-8.
- Daveu R., Laurence C., Bouju-Albert A., Sassera D., Plantard O. 2021. Symbiont dynamics during the blood meal of Ixodes ricinus nymphs differ according to their sex. Ticks and Tick-borne Diseases, 12(4):101707 [IF20=3.744] DOI: 10.1016/j.ttbdis.2021.101707.
- Jalovecka M., Hajdusek O., Sojka D., Kopacek P., Malandrin L. 2018. The Complexity of Piroplasms Life Cycles. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 8(248). [IF18=3.518] DOI: 10.3389/fcimb.2018.00248.
- Jouglin M., Rispe C., Grech-Angelini S., Gallois M., Malandrin L. 2022. Anaplasma capra in sheep and goats on Corsica Island, France: A European lineage within A. capra clade II? Ticks and Tick-borne Diseases, 13(3):101934 [IF20=3.817] DOI: 10.1016/j.ttbdis.2022.101934.
- Perez G., Bastian S., Chastagner A., Agoulon A., Rantier Y., Vourc’h G., Plantard O., Butet A. 2020. Relationships between landscape structure and the prevalence of two tick-borne infectious agents, Anaplasma phagocytophilum and Borrelia burgdorferi sensu lato, in small mammal communities. Landscape Ecology, 35(2):435-451 [IF20=3.848] DOI: 10.1007/s10980-019-00957-x.
- Plantard O., Hoch T., Daveu R., Rispe C., Stachurski F., Boué F., Poux V., Cebe N., Verheyden H., René-Martellet M., Chalvet-Monfray K., Cafiso A., Olivieri E., Moutailler S., Pollet T., Agoulon A. 2021. Where to find questing Ixodes frontalis ticks? Under bamboo bushes! Ticks and Tick-borne Diseases, 12(2):101625 [IF20=3.744] DOI: 10.1016/j.ttbdis.2020.101625.
- Rispe C., Hervet C., de la Cotte N., Daveu R., Labadie K., Noel B., Aury J.-M., Thany S., Taillebois E., Cartereau A., Le Mauf A., Charvet C. L., Auger C., Courtot E., Neveu C., Plantard O. 2022. Transcriptome of the synganglion in the tick Ixodes ricinus and evolution of the cys-loop ligand-gated ion channel family in ticks. BMC Genomics, 23(1):463 [IF21=4.560] DOI: 10.1186/s12864-022-08669-4.
- Variabilité génétique
- Génomique évolutive
- Spécificité d’hôtes
- Écologie des communautés
- Modélisation