Equipe TiBoDi (Ticks and Tick-Borne Diseases)

 

Débutées dans les années 1990 par l’étude de la piroplasmose bovine transmise par Ixodes ricinus, les recherches sur les tiques à Nantes se sont étendues à l’écologie, la génétique des populations, la phylogéographie, la systématique, la génomique et la modélisation de la dynamique des populations d’I. ricinus (mais aussi à d’autres espèces de tiques du genre Ixodes et d’autres genres de tiques dures), ainsi qu’à leurs liens avec divers microorganismes (apicomplexes – Babesia spp. et Theileria spp. -, bactéries pathogènes – Anaplasma spp., Borrelia spp. – et symbiotiques – Midichloria mitochondrii -, virus – CCHFV -). Les travaux sont réalisés (1) au laboratoire, grâce notamment à nos cultures cellulaires et collections de souches de Babesia, à notre élevage et à notre collection de tiques, à travers des approches de biologie moléculaire et d’infectiologie, (2) sur le terrain, au travers de suivis de dynamique des populations, de collectes de tiques sur animaux sauvages et de production ou de caractérisation de variables environnementales influençant l’abondance des tiques au sein des agro-écosystèmes et (3) in silico, par modélisation dynamique des processus ou analyse bioinformatique des données de séquençage haut débit. Nos projets de recherche actuels portent notamment sur (1) le séquençage complet du génome d’I. ricinus (projet GenIric, financé par France Génomique, en collaboration avec le Genoscope à Evry), (2) la caractérisation de ses neurorécepteurs (projet XenobioTick, financé par l’Institut Carnot France Future Elevage en collaboration avec l’UMR ISP à Tours et l’université d’Orléans), l’étude (3) des conséquences du changement climatique sur la dynamique des populations de tiques (implication dans les projets CC-EID puis ClimaTick, financés par le métaprogramme de l’INRA « ACCAF »), (4) du rôle du symbiote Midichloria sur la biologie d’I. ricinus,(5) de l’écologie des communautés de tiques / d’hôtes / de microorganismes hébergés et (6) de la piroplasmose équine.

Began in the years 1990s by the study of bovine piroplasmosis transmitted by Ixodes ricinus, the investigations on ticks in Nantes has extended to ecology, population genetics, phylogeography, systematics, genomics and modelisation of the population dynamics of I. ricinus (but also of other tick species from the Ixodes genus and other hard tick genera: Haemaphysalis, Dermacentor, Hyalomma…), and to their link with various microorganisms (Apicomplexa :  Babesia spp. and  Theileria spp. ; pathogenic bacteria: Anaplasma spp., Borrelia spp. ; symbiotic bacteria: Midichloria mitochondrii ; virus : CCHFV). The works are conducted (1) in the lab, notably thanks to our cell cultures and collections of Babesia strains, and our tick rearing through molecular biology and infectiology approaches, (2) in the field, through population dynamics survey, sampling of ticks on wild and domestic animals or the characterisation of environmental variables influencing the abundance of ticks within agro-ecosystems and (3) in silico by the dynamic modelisation of processes or bioinformatic analysis of high-throughput sequencing data. Our current research projects are dealing with (1) the whole genome sequencing of I. ricinus (GenIRic project, founded by France Génomique, in collaboration with the Genoscope, Evry), (2) the characterisation of its neuroreceptors (XenobioTick project, founded by  Institut Carnot France Future Elevage, in collaboration with ISP joint unit in Tours and Orleans university), the study of (3) the consequences of climate change on the population dynamics of ticks  (participation to the CC-EID then ClimaTick projects, founded by the INRA metaprogramme “ACCAF”), (4) the role of Midichloria mitochondrii on the biology of I. ricinus, (5) the community ecology of ticks/hosts and associated microorganisms and (6) the equine piroplasmosis.

Ixodes ricinus, Ixodes frontalis, Ixodes spp., Dermacentor spp., Haemaphysalis spp., Hyalomma marginatum

Babesia spp., Theileria spp., Anaplasma spp., Midichloria mitochondrii, virus CCHF

Agoulon Albert Maître de Conférences
Bastian Suzanne Maître de Conférences
Bonsergent Claire Technicienne
Daveu Romain Doctorant
De la Cotte Nathalie Technicienne
Hervet Caroline Technicienne
Hoch Thierry Ingénieur de recherche
Jouglin Maggy Assistante Ingénieure
Malandrin Laurence Chargée de recherche
Plantard Olivier Directeur de recherche
Rispe Claude Chargé de recherche
  • Agoulon A., Hoch T., Heylen D., Chalvet-Monfray K., Plantard O. 2019. Unravelling the phenology of Ixodes frontalis, a common but understudied tick species in Europe. Ticks and Tick-borne Diseases, 10:505-512. DOI:10.1016/j.ttbdis.2018.12.009.
  • Cafiso A., Bazzocchi C., De Marco L., Opara M. N., Sassera D., Plantard O. 2016. Molecular screening for Midichloria in hard and soft ticks reveals variable prevalence levels and bacterial loads in different tick species. Ticks and Tick-borne Diseases, 7(6):1186-1192. DOI: 10.1016/j.ttbdis.2016.05.005.
  • Charrier N. P., Couton M., Voordouw M. J., Rais O., Durand-Hermouet A., Hervet C., Plantard O., Rispe C. 2018. Whole body transcriptomes and new insights into the biology of the tick Ixodes ricinus. Parasites & Vectors, 11(1):364. DOI: 10.1186/s13071-018-2932-3.
  • Charrier, N. P., A. Hermouet, C. Hervet, A. Agoulon, S. C. Barker, D. Heylen, C. Toty, K. D. McCoy, O. Plantard, and C. Rispe. 2019. A transcriptome-based phylogenetic study of hard ticks (Ixodidae). Scientific Reports 9:13.
  • Hoch T., Breton E., Vatansever Z. 2018. Dynamic Modeling of Crimean Congo Hemorrhagic Fever Virus (CCHFV) Spread to Test Control Strategies. Journal of Medical Entomology, 55:1124-1132. DOI: 10.1093/jme/tjy035.
  • Hoch, T., J. Goebel, A. Agoulon, and L. Malandrin. 2012. Modelling bovine babesiosis: A tool to simulate scenarios for pathogen spread and to test control measures for the disease. Preventive Veterinary Medicine 106:136-142.
  • Jalovecka M., Bonsergent C., Hajdusek O., Kopacek P., Malandrin L. 2016. Stimulation and quantification of Babesia divergens gametocytogenesis. Parasites & Vectors, 9(1):439. DOI: 10.1186%2Fs13071-016-1731-y.
  • Jouglin M., Chagneau S., Faille F., Verheyden H., Bastian S., Malandrin L. 2017. Detecting and characterizing mixed infections with genetic variants of Anaplasma phagocytophilum in roe deer (Capreolus capreolus) by developing an ankA cluster-specific nested PCR. Parasites & Vectors, 10(1):377. DOI: 10.1186/s13071-017-2316-0.
  • Perez G., Bastian S., Chastagner A., Agoulon A., Plantard O., Vourc’h G., Butet A. 2017. Ecological factors influencing small mammal infection by Anaplasma phagocytophilum and Borrelia burgdorferi s.l. in agricultural and forest landscapes. Environmental Microbiology, 19(10):4205-4219. DOI: 10.1111/1462-2920.13885.
  • Quillery, E., O. Quenetz, P. Peterlongo, and O. Plantard. 2014. Development of genomic resources for the tick Ixodes ricinus: isolation and characterization of single nucleotide polymorphisms. Molecular Ecology Resources 14:393-400.
  • Variabilité génétique et génomique des tiques et microorganismes associés
  • Spécificité d’hôtes
  • Écologie des communautés (de tiques, de microorganismes et d’hôtes)
  • Modélisation

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UMR INRAe Oniris « BIOEPAR »

Bâtiment G2 Extension Nord
101 route de Gachet
La Chantrerie
BP 40706
44307 NANTES cedex 03

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