UMR Épidémiologie des maladies animales et zoonotiques

L’Unité Mixte de Recherche INRA-VetAgro Sup, Épidémiologie des maladies animales et zoonotiques, compte une trentaine de permanents et une dizaine de CDD et étudiants sur deux sites, Marcy-L’étoile (69) et Theix (63). Depuis 2018, l’UMR EPIA accueille des membres de la plateforme nationale d’épidémiosurveillance en santé animale (ESA) et participe à sa coordination. Cette plateforme a pour objectif d’apporter un appui aux responsables de dispositifs de surveillance de maladies animales et zoonotiques, dont l’Etat et des organisations professionnelles. Le réseau de collaborations scientifiques de l’UMR EPIA s’étend au niveau régional, national et international. L’unité travaille également en collaboration avec des acteurs de terrain tels que RESPE, GTV 63, ONF, CNPF.

L’UMR EPIA s’intéresse aux processus écologiques et évolutifs impliqués dans l’apparition, la distribution et la propagation d’agents pathogènes et de maladies présentant un risque en santé animale ou humaine (zoonoses). Elle développe des recherches selon trois axes : 1- Détection des maladies infectieuses et des facteurs de risque associés ; 2- Circulation et évolution des agents pathogènes et de leurs interactions ; 3- Développements méthodologiques.

Pour mener à bien ses travaux elle utilise ses compétences en épidémiologie, modélisation statistique et dynamique, informatique, écologie, biologie évolutive, génomique et biologie moléculaire. Plus spécifiquement un certain nombre de ses agents sont impliqués dans des travaux sur des maladies majeures en santé humaine et animale (Hantivirose, Influenza aviaire, maladie de Lyme, anaplasmose granulocytaire, fièvre catarrhale ovine, peste équine).

The INRA-VetAgro Sup Joint Research Unit, Epidemiology of Animal and Zoonotic Diseases, has 25 permanents and about ten fixed-term contracts and students in two sites, Marcy-l’étoile (69) and Theix (63). Since 2018, the UMR EPIA hosts members of the national epidemiological platform in animal health surveillance (ESA) and participates in its coordination. This platform aims to provide support to animal and zoonotic disease surveillance managers, including state and professional organizations. The network of scientific collaborations of the UMR EPIA extends from the regional to the international levels. The unit also works in collaboration with field actors such as RESPE, GTV 63, ONF, CNPF.

The UMR EPIA is interested in the ecological and evolutionary processes involved in the outbreak, distribution and spread of pathogens and diseases presenting a risk in animal or human health (zoonoses). It develops researches in three areas: 1- Detection of infectious diseases and associated risk factors; 2- Circulation and evolution of pathogens and their interactions; 3- Methodological developments.

To carry out its work, UMR EPIA uses skills in epidemiology, statistical and dynamic modeling, computer science, ecology, evolutionary biology, genomics and molecular biology. More specifically, several agents are involved in research projects on major diseases for human and animal health (Hantivirosis, Avian Influenza, Lyme disease, granulocytic anaplasmosis, bluetongue, African horse sickness).

Vecteurs : Tiques (Ixodes ricinus, Rhipicepalus sanguineus, Dermacentor sp., Hyalomma marginatum) ; Phlébotomes

Bactéries : Borrelia, Coxiella, Anaplasma, Ehrlichia,

Protozoaires : Babesia, Theileria, Cytauxzoon, Hepatozoon, Leishmania

Virus : Hantavirus

Xavier Bailly IR
Séverine Barry TR
Gilles Bourdoiseau PR
Luc Chabanne PR
Karine Chalvet-Monfray PR
Elsa Jourdain CR
Isabelle Lebert IR
Agnès Leblond PR
Sébastien Masseglia AI
Valérie Poux TR
Magalie René-Martellet MC
Julien Théze CR
Gwenaël Vourc’h DR
Maude Jacquot Post-Doc  
  • Letertre-Gibert P., Lebert I., Vourc’h G., René-Martellet M., Corbin-Valdenaire V., Portal-Martineau D., Beytout J., Lesens O. (2019). Lyme Snap: a feasibility study of on-line declarations of erythema migrans in rural areas. Ticks and Tick-Borne Diseases. https://doi.org/10.1016/j.ttbdis.2019.101301
  • Bord, S., Bioche, C., Druilhet, P. (2018). A cautionary note on Bayesian estimation of population size by removal sampling with diffuse priors. Biometrical Journal, 60, 450-462.
  • Chastagner, A., Pion, A., Verheyden, H., Lourtet, B., Cargnelutti, B., Picot, D., Poux, V., Bard, E., Plantard, O., McCoy, K., Leblond, A., Vourc’h, G., Bailly, X. (2017). Host specificity, pathogen exposure, and superinfections impact the distribution of Anaplasma phagocytophilum genotypes in ticks, roe deer, and livestock in a fragmented agricultural landscape. Infection, Genetics and Evolution, 55, 31-44.  
  • Bailly, X. (2017). Hidden markov phylogenetic models offer an interesting perspective to identify “high risk lineages” of environmental pathogens. Infection, Genetics and Evolution, 55, 45-47.
  • Dugat, T., Leblond, A., Keck, N., Lagrée, A.-C., Desjardins, I., Joulie, A., Pradier, S., Durand, B., Boulouis, H.-J., Haddad, N. (2017). One particular Anaplasma phagocytophilum ecotype infects cattle in the Camargue, France. Parasites and Vectors, 10 (1).
  • Faverjon, C., Leblond, A., Lecollinet, S., Bødker, R., de Koeijer, A. A., Fischer, E. A. J. (2017). Comparative risk analysis of two Culicoides-borne diseases in horses: equine encephalosis more likely to enter France than African horse sickness. Transboundary and Emerging Diseases, 64 (6), 1825-1836.
  • Vourc’h, A. Abrial, S. Bord, M. Jacquot, S. Masséglia, V. Poux, B. Pisanu, X. Bailly and J. Chapuis 2016 Mapping human risk of infection with Borrelia burgdorferi sensu lato, the agent of Lyme borreliosis, in a periurban forest in France Ticks and Tick-Borne Diseases
  • René-Martellet, M., Minard, G., Massot, R., Tran Van, V., Valiente Moro, C., Chabanne, L., Mavingui, P. (2017). Bacterial microbiota associated with Rhipicephalus sanguineus (s.l.) ticks from France, Senegal and Arizona. Parasites and Vectors, 10, 1-10.
  • Cat, J. (Auteur de correspondance), Beugnet, F., Hoch, T., Jongejan, F., Prangé, A., Chalvet-Monfray, K. (2017). Influence of the spatial heterogeneity in tick abundance in the modeling of the seasonal activity of Ixodes ricinus nymphs in Western Europe. Experimental and Applied Acarology, 71, 115-130.
  • Jacquot, M., Abrial, D., Gasqui, P., Bord, S., Marsot, M., Masséglia, S., Pion, A., Poux, V., Zilliox, L., Chapuis, J.-L., Vourc’h, G., Bailly, X. (2016). Multiple independent transmission cycles of a tick-borne pathogen within a local host community. Scientific Reports, 6, 31273.
  • Surveillance
  • maladies vectorielles
  • modélisation
  • Epidémiologie
  • génomique

Adresse complète

UMR Epidémiologie des maladies animales et zoonotiques

1/ INRA ARA, Site de Theix,63122 Saint-Genès Champanelle

2/ VetAgro Sup, 1 avenue Bourgelat, 69280 Marcy L’Etoile

Site internet

Tutelle(s)